本发明公开了一种利用转录因子Crz1p调控光滑球拟酵母酸胁迫抗性的方法，属于生物工程领域。本发明通过对光滑球拟酵母的Cgcrz1基因进行缺失或者过表达，相应降低或者提高了菌株的酸胁迫抗性。本发明还比较了缺失突变菌株Cgcrz1Δ在酸胁迫下细胞膜脂肪酸、甾醇成份及比例和通透性，结果发现Crz1p是光滑球拟酵母抵御酸胁迫的必需转录因子，过表达Crz1p可提高光滑球拟酵母酸胁迫抗性。